Dekanu u radu pomažu prodekani. Dekan može ovlastiti jednoga od prodekana da ga zamjenjuje u zastupanju i predstavljanju Fakulteta hrvatskih studija Sveučilišta u Zagrebu. Prodekane bira i razrješava Fakultetsko vijeće na dekanov prijedlog. U odluci o izboru pobliže se određuje područje djelovanja i nadležnost prodekana. Prodekani su članovi Dekanskoga kolegija i Fakultetskoga vijeća.
Pomoćnici obnašatelja dužnosti dekana s ovlastima prodekana Sveučilišta u Zagrebu Fakulteta hrvatskih studija:
- doc. dr. sc .Vanja Kopilaš za resor nastave i studenata
- izv. prof. dr. sc. Andreja Sršen za resor znanosti
- doc. dr. sc. Wollfy Krašić za resor međunarodne suradnje
- doc. dr. sc. Vlatko Smiljanić za resor poslovanja
- doc. dr. sc. Danijel Jurković za resor karijernog razvoja i cjeloživotne naobrazbe
Odluka o imenovanju pomoćnika obnašatelja dužnosti dekana s ovlastima prodekana